Make sure you have the following lines in your .htaccess file. If it is commented (#) just make it a comment.
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RewriteEngine On
################ CONFIGURATION ######################
### Configuration sous-repertoire
# Calcule automatiquememt le RewriteBase (qui permet de faire fonctionner
# les belles URLs). De la sorte, un meme site peut etre affiche en racine
# ou dans un sous repertoire sans devoir modifier la ligne RewriteBase.
RewriteCond %REQUEST_URI: :$1 ^(/.+)/(.*): :\2$
RewriteRule ^(.*) - [E=BASE :%1]
# Chez la plupart des hebergeurs il faut indiquer "RewriteBase /"
# sinon modifiez cette ligne
#RewriteBase /