Il me semble qu’avant la version 2.0, les statistiques n’étaient jamais sauvegardées par SPIP. Si vous n’aviez pas de sauvegardes par ailleurs, vos statistiques sont perdues.
Depuis SPIP 2, un formulaire permet de choisir les tables à sauvegarder. Par défaut, les statistiques ne sont pas sélectionnées, il faut cocher les cases correspondantes.